مرتضی زمانیان در سال ۱۳۹۴ مدرک دکتری خود را در رشته اقتصاد از دانشگاه Luigi Bocconi ایتالیا با پایان‌نامه‌ای با عنوان « چگونگی اثرگذاری سایش‌های اعتباری در نتایج سیاست‌های مالیاتی دولت » اخذ نمود. حوزه تحقیقاتی او در دوره دکتری « اقتصاد کلانِ مالی » بود که به بررسی اثر سایش‌های مالی و تحولات بازارهای اعتباری بر اقتصاد کلان می‌پرداخت. فعالیت‌های پژوهشی او همچنین شامل حوزه بانکداری و تنظیم‌گری بازارهای مالی می‌شود.

از جمله مقالات وی به « مفهوم تنظیم‌گری و ارتباط آن با نظام حکمرانی » می‌توان اشاره کرد .